I frammenti di Okazaki sono piccoli segmenti di DNA che vengono sintetizzati in modo discontinuo durante il processo di replicazione del DNA a banda singola. Sono così chiamati perché sono stati scoperti per la prima volta dallo scienziato giapponese Reiji Okazaki.
Durante la replicazione del DNA, l'elica del DNA si separa e viene aperta da un enzima chiamato elicasa. Tuttavia, poiché l'elica del DNA si apre solo in una direzione, la sintesi del nuovo filamento di DNA procede in modo continuo solo su uno dei filamenti matrice. Sull'altro filamento, chiamato filamento ritardato, la sintesi del nuovo filamento procede in modo discontinuo formando frammenti di Okazaki.
La sintesi dei frammenti di Okazaki avviene in tre fasi principali:
Iniziazione: un enzima chiamato primasi sintetizza un breve frammento di RNA chiamato primer sul filamento ritardato. Questo primer serve come punto di inizio per l'enzima DNA polimerasi che sintetizzerà il frammento di Okazaki.
Allungamento: l'enzima DNA polimerasi sintetizza un nuovo filamento di DNA in senso 5'-3' utilizzando il primer come base di partenza. Sintetizza il filamento in segmenti corti, estendendosi verso l'alto dell'elica del DNA.
Rimpiazzamento: una volta che il frammento di Okazaki è stato sintetizzato, l'enzima DNA polimerasi rimuove il primer di RNA e sostituisce i nucleotidi di RNA con nucleotidi di DNA. Infine, l'enzima DNA ligasi sigilla i frammenti di Okazaki insieme formando un filamento continuo di DNA.
I frammenti di Okazaki giocano un ruolo fondamentale nel mantenimento dell'integrità del genoma durante la replicazione del DNA. Una volta che tutti i frammenti di Okazaki sono stati sintetizzati e collegati correttamente, i due nuovi filamenti di DNA possono essere separati e i nuovi cromosomi possono essere formati.
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